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  • BLAST databases (BLASTDB) v5 Archives - NCBI Insights
    Only the latest version of BLAST+ (2 9 0, download) will work with the updated v5 databases and allow you to access all of the most recent protein and nucleotide data In the winter of 2019, we will stop updating the version 4 BLAST databases and offer the v5 databases as the default for download
  • 使用NCBI全新BLAST核心核苷酸数据库(core_nt),获得更 . . .
    BLAST是NIH比较基因组资源(CGR)的一部分。 CGR通过NCBI工具包和社区合作,促进所有真核生物的可靠比较基因组分析。 通过@NCBI社交媒体保持最新动态。
  • Bold Systems v4
    BOLD is a cloud-based data storage and analysis platform developed at the Centre for Biodiversity Genomics in Canada It consists of four main modules, a data portal, an educational portal, a registry of BINs (putative species), and a data collection and analysis workbench
  • 16S多样性测序,到底该选啥引物?! - CSDN博客
    一般而言,我们常用的V4-V5区引物有515F 907R 或者515F 926R。 这也是罗氏454测序时代最常用的16S测序引物。 在Illumina时代,由于平台测序长度的限制,V4单区测序(515F 806R)被更为广泛地使用。
  • 如何查找细菌的16S rRNA? - 知乎
    本研究采用illumina MiSeq测序平台,对经过移植的土壤微生物为研究对象,扩增了细菌16S rRNA基因的V4区域,从而得到土壤中细菌种群分布的相关信息,对其中的微生物种群变化进行了调查研究。
  • 微生物群落多样性研究——16S引物选择指南 - 知乎
    叶绿体 线粒体潜在污染较为严重的样本可考虑V5-V7区引物。 V3-V4和V4-V5适用性比较广。 若关注双歧杆菌时,可优先考虑V3-V4,关注海洋细菌SAR111时可优先考虑V4-V5。
  • BLAST: Basic Local Alignment Search Tool
    The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches
  • 02. blast - 吉大一生物信息学实验室
    blastn -db S2_1_database -query pEGE267 fasta -out pEGE267_S21_blast -outfmt 7 四将目的基因的氨基酸和某个细菌的基因组进行比较 ① makeblastdb -in S2_1 fasta -dbtype prot -out S2_1_database


















中文字典-英文字典  2005-2009